逆转肿瘤细胞成正常细胞的癌症新疗法

        肿瘤细胞也是由正常细胞恶化而来，如果能通过技术手段将肿瘤细胞的“时钟”拨回到癌变之前，是否就能让肿瘤细胞逆转成正常细胞？近日，美国圣裘德儿童研究医院和Dana-Farber癌症研究所Charles Roberts等在Nature期刊发表了题为：Targeting DCAF5 suppresses SMARCB1-mutant cancer by stabilizing SWI/SNF 的研究论文。该研究开发了一种逆转肿瘤细胞时钟的全新疗法，将恶性肿瘤恢复到正常状态，并在一种侵袭性癌症——横纹肌样瘤中取得成功。该研究表明，DCAF5对于SMARCB1突变型癌症的生存至关重要，靶向DCAF5可以使横纹肌样瘤组织恢复到癌变前。

        在这项新研究中，研究团队注意到了SMARCB1突变型癌症，这是一类由SWI/SNF染色质重塑复合物亚基失活驱动的高致命性恶性肿瘤，例如横纹肌样瘤。为了深入探究SMARCB1突变的后果及其治疗靶点，研究团队将14个SMARCB1突变细胞系纳入了近全基因组CRISPR筛选。这项研究也是癌症依赖图谱项目（DepMap）的一部分，该项目利用数百种癌细胞系系统地识别遗传依赖性、小分子敏感性和预测挖掘其生物标志物。通过分析CRISPR筛选数据，研究团队发现CUL4-DDB1 E3泛素蛋白连接酶复合物的底物受体DCAF5在SMARCB1缺失的横纹肌样瘤细胞系中具有独特依赖性。相比之下，在其他非SMARCB1缺失的SWI/SNF突变型癌症中未观察到DCAF5依赖性生存。

靶向DCAF5的成药分析（图片来源：Nature）

        研究团队进一步发现，DCAF5的敲低导致了对SMARCB1缺失的横纹肌样瘤细胞的强选择，但对其他细胞系没有效果。DCAF5敲低的横纹肌样瘤细胞系通常在几天后开始重新生长，并且随着时间推移DCAF5的敲低效果将逐渐消失。此外，研究团队无法使用CRISPR基因编辑系统在横纹肌样瘤细胞系中敲除DCAF5，但能够用对照的MCF7细胞系做到这一点。

        为了证实SMARCB1缺失细胞系对DCAF5的依赖性，研究团队使用CRISPR-Cas9生成SMARCB1敲除的HEK293T细胞系，然后进行回补实验诱导其重新表达SMARCB1。结果表明，DCAF5的敲低对表达SMARCB1的HEK293T细胞系没有影响，但会损害SMARCB1缺失的HEK293T细胞系的增殖。这些数据表明，在SMARCB1缺失的情况下，DCAF5对细胞存活至关重要。进一步研究表明，DCAF5对SWI/SNF复合物具有质量控制功能，并在没有SMARCB1的情况下促进不完全组装的SWI/SNF复合物的降解。当DCAF5被敲低后，SMARCB1缺失细胞系的SWI/SNF复合物重新积累并结合靶位点，将SWI/SNF介导的基因表达恢复到足以逆转癌症状态的水平。

        在横纹肌样瘤等SMARCB1突变型癌症中，对DCAF5进行了基因敲除或化学降解，可以将这类癌细胞恢复到癌变前状态，并且这一效应即使在小鼠模型中也持续存在。这项研究展示了一个抗癌新思路：没有制造直接杀死横纹肌样瘤的毒性事件，而是通过使细胞恢复正常来逆转癌症状态。这种全新的癌症治疗方式将是变革性的，这一范式也可以应用于其他肿瘤抑制因子缺失引起的癌症。从治疗的角度来看，此前DCAF蛋白家族已被证明可以成药。在安全性方面，敲除DCAF5对小鼠没有明显健康影响，但对于SMARCB1缺失突变的癌细胞却有治疗奇效。因此，靶向DCAF5将避免放射或化疗的脱靶毒性，可作为一种十分有应用前景的癌症治疗新靶点。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41586-024-07250-1

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